대학원생이 연구하면서 공부하고있는 내용들을 정리하면서 포스팅입니다.
내용이 부족할수 있으니 참고 바랍니다.
의료 영상분석을 진행하기 위해서 뇌 data에 접근하면 .dcm형식의 파일로 되어있다.
이를 NIfTI 이미지형식인 nii 혹은 nii.gz로 바꾸기 위해서는 dcm2nii를 이용하면 간단하다.
NIfTI 이미지 형식 표준은 뇌 이미지의 과학적 분석을 위해 설계되었다.
NIfTI의 좋은 점 중 하나는 형식이 공간 방향 정보를 유지하려고한다는 것이다.
DCM2NII는 이미지를 FSL, SPM5, MRIcron 및 기타 여러 뇌 이미징 도구에서 사용하는 NIfTI 형식으로 변환한다.
DCM2NII는 MRIcron과 함께 배포되는 독립형 프로그램으로. 기본적으로 Windows, Linux x86, Mac OSX PPC 및 Mac OSX x86 용으로 컴파일되어있다.
리눅스 기준 다음과같은 커맨드라인으로 사용할수있다.
$dcm2nii -v /data/path/-v 옵션은 지정된 디렉토리의 모든 이미지를 변환하겠다는 옵션이다.
더욱 자세한 내용은 다음을 참고하길 바란다.
https://people.cas.sc.edu/rorden/mricron/dcm2nii.html
dcm2nii DICOM to NIfTI conversion
Introduction Important note: dcm2nii is obsolete. While I hope it is generally robust and useful, active development has moved to dcm2niix. In general, dcm2niix is typically better suited for modern DICOM images. On the other hand, dcm2nii is useful for
people.cas.sc.edu
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