Statistics (4) 썸네일형 리스트형 [에러해결]cannot rescale a constant/zero column to unit variance prcomp in R prcomp로 PCA를 그리기위해 주성분 분석을 수행하던중 다음과 같은 에러를 만났다. "cannot rescale a constant/zero column to unit variance" Error in prcomp.default(toy, scale. = TRUE): cannot rescale a constant/zero column to unit variance Traceback: 1. prcomp(toy, scale. = TRUE) 2. prcomp.default(toy, scale. = TRUE) 3. stop("cannot rescale a constant/zero column to unit variance") 이는 PCA분석을 진행할때 사용되는 데이터 table의 열(column)중에 분산이 .. heatmap 그리고 저장하기 in R heatmap은 데이터 분석을 진행하다보면 scatter plot 만큼 접하기 쉬운 plot이다. matrix값을 ploting 하고 Hierarchical clustering 까지 확인할 수 있기때문에 인기가 많다. 오늘은 R로 heatmap그리는 법을 간단하게 알아보겠다. library(gplots) library(RColorBrewer) 우선 위의 라이브러리를 설치하고 import 한다. input table은 아래와같이 numeric matrix로 이루어져있어야한다. 1. 기본적인 코드 mypalette KDE(Kernel Density Estimation) - 커널 밀도 함수 추정 KDE(커널 밀도 함수 추정) Kernel density estimation(KDE) is a way to estimate the probability density function (PDF) of a random variable in a non-parametric way. 밀도 추정 (Density Estimation) 관측된 데이터들의 분포로부터 변수의 분포 특성을 추정 어떤 변수 x의 밀도를 추정하는 것은 x의 확률밀도함수 (pdf, probability density function)을 추정하는것과 동일 Parametric vs. Non-parametric density estimation Parametric : 미리 pdf에 대한 모델을 정해놓고 데이터들로부터 모델의 파라미터만 추정. non-p.. R - CI(confidence Interval)구하기 n=100, 평균 = 100 표준편차 = 10일때 95%(=1.96%) 신뢰 구간 구하기 n 이전 1 다음
